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我国科学家首次发现苹果具有核酶活性环状RNA

日期:2015-01-15 00:00:00

近日,中国农业科学院植物保护研究所研究员李世访研究团队与中国科学技术大学吴清发教授研究团队合作,在世界上首次发现苹果中存在具有核酶活性的环状RNA。上世纪80年代,在研究苹果上一种危害严重的病害——苹果锈果病时,中国农业科学院兴城果树研究所的果树病毒专家刘福昌研究员和日本果树病毒专家小金泽硕城均从苹果中分离到一种特殊环状RNA。但是,限于检测及分析技术的限制,一直未能揭示出它的真面目。

 
2012年,在一次国际会议中,李世访结识了专门从事生物信息学研究的吴清发,并决定共同探究苹果中环状RNA的真面目。
 
研究团队采用了高通量测序(NGS)技术结合生物信息学分析的策略。他们重新编译了PFOR2程序,其运行速度比PFOR提高了3~8倍,从而能够处理高通量测序获得的大量数据。通过对含有环状RNA的苹果锈果样品进行高通量测序,经过几个月的摸索和反复验证,终于拿到了该环状RNA的全序列。
 
序列分析发现,该环状RNA由434个核苷酸组成,是一种迄今为止从未见过报道的新的环状RNA。自中国报道后,美国、意大利等国研究人员的检测结果也为此提供了有力的佐证。有意思的是,生化实验表明,该环状RNA正、负链均具有核酶活性,能够进行自我剪切。该研究为今后从植物和动物中发现更多环状RNA提供了新的思路和技术手段。

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